原址位于大三巴牌坊遗址处，于1835年1月26日毁于一场大火，现仅存教堂前壁--大三巴牌坊，成为澳门的标志之一及著名的旅游景点。

　　被焚毁的圣保禄教堂由一名意大利籍神父设计，揉合了欧洲文艺复兴时期与东方建筑的风格，由日本工匠精雕细刻费时25年于1637年建成，是当时远东最大的天主教堂。造价自然不菲，仅现存的大三巴牌坊，300年前造价已达3万两银子。教堂前那段长长的68级石阶也在不久后完成。教堂附设修道院，课程有神哲学、理学及其他科学，规模不亚于当时欧洲的大学，培养了不少传教士。明清时，意大利的利玛窦、德国的汤若望及我国画家吴历等先后来此研经修道。

　　圣保禄教堂与火有不解之缘，从建造之初起先后经历三次大火。1595年第一次大火，将十六世纪中叶兴建的教堂及修院全部焚毁。在澳传教士因传教需要，照原样又重新修建一座，1601年时又再次毁于大火。经在澳传教士多方筹款后，进行再次重建，此后，奠定了圣保禄教堂200年的历史，直到1853年毁于最后一场大火。1835年1月26日傍晚，澳门遭受强台风袭击，圣保禄教堂起火，风助火势，足足烧了两个多小时，使这座远东著名的大教堂剩下一堵形似中国牌坊的门壁，也是教堂最珍贵的前壁供后人凭吊。